使用短程分子蒸馏设备时采用其高真空以及低蒸馏温度，设备可以短停留时间，整个设备高蒸发效率，在使用时可以连续蒸馏过程，短程分子蒸馏设备对于高分子量高沸点以及热敏性以及易氧化的物料进行分离。
　　设备可以清理其液体中的低分子物质，比如其臭味以及有机溶剂，设备有选择的蒸出目的产物，去除其他杂质，因此被视为天然品质的保护者和回归者。
　　使用短程分子蒸馏设备时能够实现其传统分离方法没有办法进行实现的物理过程，因此在这些高价植物料的分离上被用作脱臭、脱色及提纯的手段，蒸发器壁面自清洁，污染较小，清洗容易。
　　设备中由于其轻物质汽相在内即被冷凝，这样就会使得真空压降小可保持设备内会较高额真空度，短程蒸馏的构造设计，允许操作压力到低的操作真空，实验规模的设备真空可达0.1Pa。
　　短程分子蒸馏设备在进行操作的过程中其温度是远低于物料的沸点，由于其设备采用其中心冷凝，物料流动截面积等于蒸发表面，这样就会使得蒸发器以及冷凝器之间存在轻微的压降。